组织依法行政有关问题调查研究，拟订相关政策措施并指导实施。承担有关规范性文件的起草、合法性审核和清理工作。承担行政复议、行政应诉相关工作。组织指导水政监察和水行政执法，协调跨师市、兵地、中央驻疆单位水事纠纷，组织查处重大涉水违法事件。组织兵团水资源费、水土保持补偿费的征收及监督使用。督促检查水利重大政策、决策部署和重点工作的贯彻落实情况。组织协调和推进落实水利行业重要事项的督办工作。组织实施水利工程质量和安全监督。指导水利行业安全生产工作，指导水库、水电站大坝及农村水电站的安全监管。